La version 2000-9 est adaptée aux missions air-sol grâce notamment à une liaison de données, des moyens de navigation et de tir supplémentaires, des contremesures adaptées et une nacelle de ravitaillement en vol d'autres 2000-9.
Les appareils doivent être armés du missile Black Shaheen, dérivé de l'Apache et pourvu de la version infrarouge du Mica. Enfin, dernier client en date, la Grèce a commandé 15 avions en avril 1999, également dans une version particulière, dite Mirage 2000-5 Mk2. Le pays a aussi décidé de la mise à ce standard de dix de ses anciens Mirage 2000 EG qui verront leur radar RDM remplacé par un radar RDY.
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